Νέες ακριβείς δοκιμές μπορούν τώρα να ανιχνεύσουν ειδικά τη γρίπη των πτηνών υψηλής παθογονικότητας. Αυτές οι δοκιμές που αναπτύχθηκαν από το ΚΚΕρ μπορούν να παρακολουθούν την εξάπλωση του ιού σε διάφορα δείγματα, συμπεριλαμβανομένων των λυμάτων.
Η γρίπη των πτηνών A (H5N1) είναι μια εξαιρετικά μεταδοτική ασθένεια των πτηνών που έχει ήδη μολύνει εκατομμύρια πτηνά και τώρα εμφανίζεται σε ορισμένα θηλαστικά.
Εξαπλώνεται γρήγορα σε όλο τον κόσμο, οδηγώντας σε μαζική σφαγή ορνίθων σε πτηνοτροφικές εκμεταλλεύσεις λόγω της εξαιρετικά μεταδοτικής και θανατηφόρας φύσης του. Αυτό είχε ως αποτέλεσμα σημαντικές διαταραχές στην παγκόσμια βιομηχανία πουλερικών, με παραδείγματα όπως οι αυξανόμενες τιμές των αυγών στις ΗΠΑ.
Η γρίπη των πτηνών προκαλεί ανησυχία, καθώς μπορεί να διασχίσει το φράγμα των ειδών και να μολύνει θηλαστικά, συμπεριλαμβανομένων των αγελάδων, των γατών και των ανθρώπων. Αν και δεν έχει εξαπλωθεί μεταξύ των ανθρώπων, η ικανότητά του να μολύνει θηλαστικά εγείρει ανησυχίες για τη δημόσια υγεία και απαιτεί αυξημένη παρακολούθηση.
Ποια τεχνολογία βρίσκεται πίσω από τις νέες δοκιμές
Το ΚΚΕρ, σε συνεργασία με το Εργαστήριο αναφοράς της Ευρωπαϊκής Ένωσης (EURL) για τη γρίπη των πτηνών και την ψευδοπανώλη των πτηνών, ο Βέλγος Σιενσάνο και ο Ιταλός Istituto Superiore di Sanità, ανέπτυξαν δύο ψηφιακές δοκιμασίες RT-PCR. Η μια είναι ικανή να ανιχνεύσει ειδικά τους υψηλής παθογονικότητας ιούς του κλάδου A(H5Nx) της γρίπης A(H5Nx) που είναι γνωστοί για την εξάπλωσή τους σε ολόκληρο τον κόσμο και η δεύτερη είναι ικανή να ανιχνεύσει ένα ευρύτερο φάσμα ιών της γρίπης Α, συμπεριλαμβανομένης της εποχικής γρίπης. Μπορούν να χρησιμοποιηθούν χωριστά ή σε συνδυασμό ως ενιαία διαγνωστική προσέγγιση (δοκιμασία διπλής όψης).
Η αλυσιδωτή αντίδραση πολυμεράσης αντίστροφης μεταγραφής (RT-PCR) είναι μια εργαστηριακή τεχνική που χρησιμοποιείται για την ανίχνευση της παρουσίας ενός συγκεκριμένου ριβονουκλεϊνικού οξέος (RNA) σε ένα δείγμα. Οι δοκιμασίες που βασίζονται σε RT-PCR μπορούν να εντοπίσουν RNA που φέρουν το γενετικό υλικό συγκεκριμένων ιών, συμπεριλαμβανομένων των ιών της γρίπης, όπως αυτός που προκαλεί τη γρίπη των πτηνών. Η ανίχνευση αυτών των RNAs σε ένα κλινικό δείγμα, δείχνει ότι το εξεταζόμενο άτομο – άνθρωπος ή ζώο – έχει μολυνθεί από τον ιό.
Οι πρόσφατα αναπτυγμένες ψηφιακές δοκιμές RT-PCR είναι προηγμένες και πιο ευαίσθητες από τις συμβατικές εκδόσεις RT-PCR. Οι ψηφιακές δοκιμές είναι ένας τρόπος υψηλής ακρίβειας για την ανίχνευση και τη μέτρηση μικροσκοπικών ποσοτήτων του γενετικού υλικού RNA του ιού, ακόμη και σε πολύπλοκες μήτρες, όπως δείγματα λυμάτων, όπου μπορεί να συνυπάρχουν περισσότερα από έναν ιό.
Η καινοτομία των ψηφιακών δοκιμασιών RT-PCR έγκειται στην ικανότητά τους να διακρίνουν ειδικά μεταξύ των ιών A(H5Nx) του κλάδου 2.3.4.4b και άλλων ιών Α, συμπεριλαμβανομένης της εποχικής ανθρώπινης γρίπης, σε μία μόνο δοκιμή. Προηγουμένως, η διάκριση μεταξύ αυτών των ιών ήταν πιο δυσκίνητη, δαπανηρή και χρονοβόρα, συχνά απαιτώντας πολλαπλές δοκιμές και αλληλουχία.
Οι δοκιμασίες αναπτύχθηκαν γρήγορα χρησιμοποιώντας μια συγκεκριμένη υπολογιστική ροή εργασίας που πρωτοστάτησε το JRC και προηγουμένως εφαρμόστηκε με επιτυχία για την ανάπτυξη δοκιμασιών SARS-CoV-2:
για την ειδική ανίχνευση του BA.2.86 SARS-CoV-2 και των απογόνων του (2024)
για την ανίχνευση τρεχουσών και μελλοντικών παραλλαγών του SARS-CoV-2 (2023).
Ένα άλλο παράδειγμα είναι η χρήση αυτής της υπολογιστικής ροής εργασιών για την παραγωγή πιστοποιημένου υλικού αναφοράς —το πρώτο του είδους του στην ΕΕ— για τη βελτίωση της ακρίβειας των διαγνωστικών εξετάσεων για τη νόσο COVID-19.
Για τις νέες δοκιμασίες RT-PCR, η ροή εργασίας ανέλυσε χιλιάδες αλληλουχίες γρίπης των πτηνών για να εντοπίσει τα πιο διατηρημένα και ειδικά γενετικά στοιχεία μοναδικά για τον κλάδο 2.3.4.4b, επιτρέποντας ακριβή και ταχεία διαφοροποίηση σε πολύπλοκα δείγματα.
Οι νέες δοκιμασίες επιτρέπουν την ανίχνευση και την αντιμετώπιση εστιών πολύ πιο γρήγορα και αποτελεσματικά. Οι δοκιμές είναι έτοιμες και διαθέσιμες προς χρήση από όλα τα εργαστήρια που συμμετέχουν στην επιτήρηση της γρίπης των πτηνών, συμπεριλαμβανομένων εκείνων που ασχολούνται με την επιτήρηση των λυμάτων.
Πλαίσιο πολιτικής
Η ανάπτυξη αυτών των δοκιμών στηρίζει τον κανονισμό (ΕΕ) 2022/2371 σχετικά με σοβαρές διασυνοριακές απειλές κατά της υγείας, επιβεβαιώνοντας τον καίριο ρόλο των συστημάτων επιτήρησης στον μετριασμό των αρνητικών επιπτώσεων των σοβαρών διασυνοριακών παθογόνων απειλών.
Στον τομέα της υγείας των ζώων, οι εργασίες σχετικά με τις δοκιμές στηρίζουν την εφαρμογή των απαιτήσεων για την επιτήρηση της γρίπης των πτηνών στην ΕΕ, οι οποίες ορίζονται στο παράρτημα II του κατ’ εξουσιοδότηση κανονισμού (ΕΕ) 2020/689.
Η αναθεωρημένη οδηγία για την επεξεργασία των αστικών λυμάτων, η οποία τέθηκε σε ισχύ την 1η Ιανουαρίου 2025, θεωρεί τον ιό της γρίπης ως στόχο επιτήρησης.
Σχετικό περιεχόμενο
Νέες δοκιμασίες (d)PCR για τον κλάδο των ιών της γρίπης A(H5Nx) 2.3.4.4b επιτήρηση.
